Posts filed under ‘Infecciones micoticas’

A Rose by Any Other Name: Practical Updates on Microbial Nomenclature for Clinical Microbiology

Journal of Clinical Microbiology January 2017 V.55 N.1 P.3-4


Colleen S. Kraft, Alexander J. McAdam, and Karen C. Carroll

aDepartment of Pathology and Laboratory Medicine, Division of Infectious Disease, Emory University, Atlanta, Georgia, USA

bDepartment of Laboratory Medicine, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, USA

cDivision of Medical Microbiology, Department of Pathology, The Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland, USA

The clinical microbiology laboratory stands at the interface between basic science, including the study of phylogeny, and applications of science in the very practical world of medical care.

In this context, it is important that laboratory reports balance scientific accuracy with medical utility, and it is particularly difficult to do this in the naming of microorganisms.

New organisms are discovered and named, and our understanding of the relationships between known organisms improves, resulting in the reclassification and renaming of organisms as they are sorted into the correct groups.

In this issue of Journal of Clinical Microbiology, we are pleased to provide several minireviews that are intended to help clinical microbiologists keep up-to-date with changes in nomenclature for bacteria (1), parasites (2), viruses (3), and fungi (4).

Most of these minireviews focus on human pathogens, but the minireview on viruses includes those affecting nonhuman animals. An article about mycobacterial nomenclature is in preparation and will be published in Journal of Clinical Microbiology when available.

The idea for this informative resource was proposed by Dr. Karen Carroll at the editors’ meeting in 2015.

The editors enthusiastically agreed these reviews would be a useful resource for clinical microbiologists, infectious diseases physicians, laboratory technologists, pharmacists, and infection preventionists, in addition to fostering discussion and teaching of trainees and students.

Several editors volunteered to write the articles, and we plan to update these minireviews every 2 years if they prove to be as useful as we expect….



October 19, 2017 at 3:02 pm

Efficacy of anidulafungin in 539 patients with invasive candidiasis: a patient-level pooled analysis of six clinical trials

Journal of Antimicrobial Chemotherapy August 2017 V.72 N.8 P.2368–2377

Bart Jan Kullberg; José Vasquez; Piroon Mootsikapun; Marcio Nucci; José-Artur Paiva …


To evaluate the efficacy of anidulafungin for the treatment of candidaemia and invasive candidiasis in a large dataset, including patients with deep-seated tissue candidiasis, neutropenia and infection due to non-albicans Candida species.


Data were pooled from six prospective, multicentre, multinational studies: four open-label, non-comparative studies of anidulafungin and two double-blind, double-dummy, randomized studies of anidulafungin versus caspofungin (clinical trial registrations: NCT00496197, NCT00548262, NCT00537329, NCT00689338, NCT00806351 and NCT00805740; In all studies, patients with culture-confirmed invasive candidiasis received a single intravenous (iv) loading dose of anidulafungin 200 mg on day 1, followed by 100 mg once-daily. Switch to oral fluconazole or voriconazole was permitted after 5–10 days of iv treatment in all studies except one. Antifungal treatment (iv plus oral therapy if applicable) was maintained for ≥14 days after the last positive Candida culture. The primary endpoint was successful global response at end of iv therapy (EOivT) in the modified ITT (mITT) population.


In total, 539 patients were included (mITT population). The most common baseline Candida species were Candida albicans (47.9%), Candida glabrata (21.0%), Candida tropicalis (13.7%), Candida parapsilosis (13.2%) and Candida krusei (3.5%). Median duration of anidulafungin iv treatment was 10.0 days. The global response success rate at EOivT was 76.4% (95% CI 72.9%–80.0%). All-cause mortality was 13.0% on day 14 and 19.1% on day 28. Adverse events (AEs) were consistent with the known AE profile for anidulafungin.


These data demonstrate that anidulafungin is effective for treatment of candidaemia and invasive candidiasis in a broad patient population.


August 11, 2017 at 9:11 am

Candida vertebral osteomyelitis (CVO) 28 cases from a 10-year retrospective study in France

MEDICINE August 2017 V.96 N.31

Richaud, Clémence; De Lastours, Victoire; Panhard, Xavière; Petrover, David; Bruno, Fantin; Lefort, Agnès


Although increasingly frequent, little is known about the clinical presentation, radiological signs, and outcome of Candida vertebral osteomyelitis (CVO).

We performed a nationwide retrospective study of laboratory-confirmed cases of CVO over a 10 year-period in France with a prolonged follow-up.

We describe demographic, clinical, biological, and radiological characteristics of patients with CVO, patients’ management, and long-term outcome and determine factors associated with a poor outcome.

In total, 28 patients with laboratory-confirmed CVO were included. A prior systemic Candida infection was evidenced in 13/28 (46%), occurring a median of 6 weeks before CVO was diagnosed.

Twenty-six of 28 (93%) had at least 1 underlying condition at risk of invasive fungal disease, and in 19/28 (68%) CVO was health-care related.

C albicans was most frequently identified (21/28; 75%) Lumbo-sacral involvement was the most prevalent (20/28—71%). Nearly half patients had no fever at presentation, but all had pain.

Initial antifungal therapy consisted in fluconazole in 15/28 (53%); surgery was needed in 5 (18%) cases.

One-year mortality was 21% (6/28), directly related to fungal infection in 2 patients.

Risk-factors associated with 1-year mortality were age (P=.02), a high Charlson comorbidity index (P = .001), and a shorter treatment duration (median, 3 months vs 6 months; P = .02).

Among 22 patients who survived, the median follow up duration was 15.5 months (8–93.5); 10 had sequelae, consisting in pain in all and neurological deficit in one.

A longer treatment duration was significantly associated with healing without sequelae (P = .04).

CVO concerns patients with serious underlying conditions and risk-factors for invasive candidiasis.

Prolonged antifungal treatment appears to improve survival without sequelae.


August 5, 2017 at 9:18 am

Rapid and Accurate Molecular Identification of the Emerging Multidrug-Resistant Pathogen Candida auris

Journal of Clinical Microbiology August 2017 V.55 N.8 P.2445-2452

Milena Kordalewska, Yanan Zhao, Shawn R. Lockhart, Anuradha Chowdhary, Indira Berrio, and David S. Perlin

aPublic Health Research Institute, Rutgers Biomedical and Health Sciences, Newark, New Jersey, USA

bMycotic Diseases Branch, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Georgia, USA

cDepartment of Medical Mycology, Vallabhbhai Patel Chest Institute, University of Delhi, Delhi, India

dClínica El Rosario, Medellín, Colombia

eMedical and Experimental Mycology Group, Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB), Medellín, Colombia

fHospital General de Medellin Luz Castro de Gutiérrez ESE, Medellín, Colombia

Candida auris is an emerging multidrug-resistant fungal pathogen causing nosocomial and invasive infections associated with high mortality. C. auris is commonly misidentified as several different yeast species by commercially available phenotypic identification platforms. Thus, there is an urgent need for a reliable diagnostic method. In this paper, we present fast, robust, easy-to-perform and interpret PCR and real-time PCR assays to identify C. auris and related species: Candida duobushaemulonii, Candida haemulonii, and Candida lusitaniae. Targeting rDNA region nucleotide sequences, primers specific for C. auris only or C. auris and related species were designed. A panel of 140 clinical fungal isolates was used in both PCR and real-time PCR assays followed by electrophoresis or melting temperature analysis, respectively. The identification results from the assays were 100% concordant with DNA sequencing results. These molecular assays overcome the deficiencies of existing phenotypic tests to identify C. auris and related species.


July 26, 2017 at 9:29 am

Aspergilosis. Formas clínicas y tratamiento

Enf Infecciosas & Microbiologia Clínica Abril 2012 V.30 N.4

Jesús Fortún, Yolanda Meije, Gema Fresco, Santiago Moreno.

Servicio de Enfermedades Infecciosas, Hospital Ramón y Cajal, Madrid, España


La aspergilosis invasiva junto con la aspergilosis crónica pulmonar y la aspergilosis broncopulmonar alérgica, constituyen las formas clínicas de aspergilosis.

Aunque el número de especies de Aspergillus spp. es muy numeroso, Aspergillus fumigatus-complex es el agente etiológico más frecuente, independientemente de la forma clínica y la afección de base del paciente.

El incremento de los diferentes tratamientos inmunosupresores y el mayor uso de corticoides en pacientes con enfermedad obstructiva crónica han condicionado un mayor protagonismo de la aspergilosis en los últimos años.

El uso de galactomanano y las pruebas de imagen complementan las limitaciones microbiológicas en el diagnóstico de estos pacientes. Voriconazol y anfotericina liposomal constituyen la base del tratamiento en todas las formas de aspergilosis, y posaconazol, itraconazol, caspofungina y otras equinocandinas son alternativas eficaces.

El pronóstico depende de la forma clínica y las características del huésped, pero es sombrío fundamentalmente en las formas invasivas diseminadas.



July 17, 2017 at 8:11 am

Ongoing Transmission of Candida auris in Health Care Facilities – United States, June 2016-May 2017.

Morbidity and Mortality Weekly Report. May 19, 2017 V.66 N.19 P.514-515

Notes from the Field

Tsay S, Welsh RM, Adams EH, Chow NA, Gade L, Berkow EL, Poirot E, Lutterloh E, Quinn M, Chaturvedi S, Kerins J, Black SR, Kemble SK, Barrett PM; MSD, Barton K, Shannon DJ, Bradley K, Lockhart SR, Litvintseva AP, Moulton-Meissner H, Shugart A, Kallen A, Vallabhaneni S, Chiller TM, Jackson BR.

In June 2016, CDC released a clinical alert about the emerging, and often multidrug-resistant, fungus Candida auris and later reported the first seven U.S. cases of infection through August 2016 (1).

Six of these cases occurred before the clinical alert and were retrospectively identified.

As of May 12, 2017, a total of 77 U.S. clinical cases of C. auris had been reported to CDC from seven states: New York (53 cases), New Jersey (16), Illinois (four), Indiana (one), Maryland (one), Massachusetts (one), and Oklahoma (one) (Figure). All of these cases were identified through cultures taken as part of routine patient care (clinical cases).

Screening of close contacts of these patients, primarily of patients on the same ward in health care facilities, identified an additional 45 patients with C. auris isolated from one or more body sites (screening cases), resulting in a total of 122 patients from whom C. auris has been isolated…..


June 28, 2017 at 5:53 am

Multidrug-resistant Candida auris: “new kid on the block” in hospital-associated infections?

Rev Chilena Infectol. April 2017 V.34 N.2 P.192.

Revista de Revistas

Candida auris multi-resistente en infecciones nosocomiales.

Fuente: Chowdhary A, Voss A, Meis J F. J Hosp Infect 2016; 94: 209-12.

[Article in Spanish]

Tapia C1, Batarce C1.

Author information

1 Facultad de Medicina, Universidad de Chile, Chile.

Es un artículo de revisión sobre una levadura emergente, Candida auris. Se destaca la importancia de la emergencia de esta especie en infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS).

Candida auris fue aislada por primera vez en una muestra ótica (2009), y posteriormente en sangre. Ya ha producido varios brotes de candidemia en el mundo.

Calvo y cols., reportaron el primer aislado en Latinoamérica en 2016. Es una especie que presenta multirresistencia a los antifúngicos.

Infecciones del torrente sanguíneo (ITS) por Candida y las implicancias de las especies no albicans:

Estimándose en 400.000 casos en el mundo, la infección por Candida spp. es más frecuente en países en vías de desarrollo. Las tasas de mortalidad cruda y atribuible a candidemia es de 42 y 27%, respectivamente.

La colonización por Candida ocurre en más de 80% de los pacientes críticamente enfermos, después de una semana en Unidad de Cuidados Intensivos (UCI). A pesar de los avances en pruebas diagnósticas rápidas, el diagnóstico microbiológico de la candidemia es tardío.

Por otra parte la distribución de especies ha cambiado en los últimos años, con emergencia de especies no-albicans, lo que se ha asociado a la profilaxis con azoles y equinocandinas, que ha ido seleccionando especies multi-resistentes. Candida auris ha emergido como agente de IAAS, causando falla terapéutica y diseminación en el ambiente hospitalario.

Esta especie es resistente a la primera línea de antifúngicos como fluconazol, exhibiendo susceptibilidad variable al resto de los azoles, anfotericina B y equinocandinas.

Estas infecciones deben ser notificadas al centro de control de enfermedades (CDC) de E.U.A.

Emergencia mundial y diseminación nosocomial de C. auris multi-resistente en centros de salud:

Desde la aparición del primer caso de candidemia en Corea, este agente se ha diseminado por el mundo, con casos en hospitales de India, Sudáfrica, Kuwait, Brasil, Venezuela, E.U.A, Reino Unido y Paquistán.

Cabe señalar, que ha habido identificaciones erróneas de esta especie anteriormente, pudiendo ser informadas como C. haemulonii, C. sake, Sacharomyces cerevisiae y Rodothorula glutinis por sistemas como Vitek2 y API20C-AUX.

El diagnóstico de C. auris se realiza fundamentalmente mediante secuenciación (regiones ITS o LSU) o por “matrix-assisted laser desorption//ionization time-of-flight mass espectrometry” (MALDI-TOF). Un nuevo panel independiente de cultivo “T2 Candida panel” detectaría rápida y directamente cinco agentes de candidemia, pero no C. auris.

Los pacientes con C. auris tienen riesgos similares que aquellos con otras especies de Candida.

La mortalidad cruda de la candidemia por C. auris es de 30-70% y se asocia a cuadros prolongados (10-50 días) lo que facilita la diseminación en el hospital.

Estudios recientes en aislados en India, sugieren una baja diversidad genética de las cepas (alto parentezco) lo que hace pensar que posiblemente esta especie emergió sólo recientemente.

Resistencia antifúngica de C. auris

Aún no existen puntos de corte para la susceptibilidad de C. auris a los antifúngicos. Esta especie es altamente resistente a fluconazol (CIM90 > 64 mg/L) y un tercio de los aislados presenta una CIM elevada a voriconazol (≥ 2 mg/L) y a anfotericina B.

Pocas cepas tienen CIMs elevadas a equinocandinas. Su perfil de resistencia a las tres grandes familias de antifúngicos limita las alternativas terapéuticas.

Esta especie se encuentra relacionada genéticamente con C. haemulonii, que tiene resistencia intrínseca a anfotericina B y fluconazol.

Hasta el momento no se conocen claramente los mecanismos de resistencia. Al parecer sería inducible por la presión de selección produciendo cambios mutacionales rápidos.

Un estudio genético reciente demostró que esta especie tendría copias únicas de varios genes relacionados con resistencia a los antifúngicos como ERG3, ERG11, FKS1, FKS2 y FKS3 además de una mayor proporción de genes de familias de transportadores ABC y MSF (bombas de eflujo), que podrían explicar la multirresistencia.

Es probable que el uso no meditado de antifúngicos, se haya traducido en la emergencia de C. auris como un patógeno multi-resistente exitoso.

Dada las elevadas CIMs a anfotericina B, como terapia de primera línea debieran usarse equinocandinas, con prueba de susceptibilidad antifúngica. Además debe vigilarse la susceptibilidad antifúngica en pacientes infectados o colonizados por este agente.

Prevención y control de infecciones

La colonización por este microorganismo es difícil de erradicar, tendiendo a persistir. También se han descrito reservorios ambientales en algunos brotes.

El CDC recomienda en pacientes colonizados e infectados el uso de habitación individual y precauciones estándar y de contacto.

También se sugiere un tamizaje semanal de colonización de piel y mucosas en pacientes con larga estadía hospitalaria, pues aún se desconoce el sitio de predilección de colonización por este agente.

Debe haber coordinación multidisciplinaria entre microbiólogos y especialistas en IAAS de cada institución para implementar políticas de control.

Los elementos clave son: adherencia al lavado de manos del personal de salud, medidas generales de prevención y control de infecciones en cuanto al ambiente y fomites, a pesar que C. auris in vitro es multi-resistente a varios agentes desinfectantes, una política eficiente de eliminación de desechos y estudio cauteloso de los beneficios de la profilaxis antifúngica en unidades clínicas donde C. auris haya sido aislada, por el riesgo de diseminación de esta especie cuando se usa fluconazol profiláctico.


El impacto potencialmente devastador de las infecciones invasoras por esta especie multi-resistente tanto en pacientes como en servicios clínicos no debe ser desestimado.

Se requiere continuar aportando información al conocimiento de la epidemiología global de esta infección emergente y de cómo prevenirla.

En Chile, hasta el momento no hay casos descritos, pero debemos estar atentos pues esta especie se ha diseminado rápidamente habiéndose ya descrito en Latinoamérica.

Cecilia Tapia y Christian Batarce

Programa de Microbiología y Micología, ICBM – Facultad de Medicina, Universidad de Chile.



June 27, 2017 at 8:29 am

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